本站小編為你精心準(zhǔn)備了棉花后代群體篩選方式分析參考范文,愿這些范文能點(diǎn)燃您思維的火花,激發(fā)您的寫作靈感。歡迎深入閱讀并收藏。
轉(zhuǎn)基因植株的篩選鑒定是植物轉(zhuǎn)基因研究的重要環(huán)節(jié)。目前,轉(zhuǎn)基因棉花篩選鑒定的常用方法為卡那霉素篩選法和PCR分子檢測(cè)法[1-2]。針對(duì)不同試驗(yàn)?zāi)康模@兩種方法相關(guān)報(bào)道的文獻(xiàn)較多,但都有較強(qiáng)的針對(duì)性,在實(shí)際轉(zhuǎn)基因棉花育種過程中,這兩種方法的應(yīng)用均存在弊端。卡那霉素篩選法不能反映目的基因的表達(dá)效果,其篩選結(jié)果缺乏可靠性。PCR分子檢測(cè)法對(duì)試驗(yàn)室要求嚴(yán)格,檢測(cè)費(fèi)用昂貴,檢測(cè)周期長。此外,轉(zhuǎn)基因克隆研究的發(fā)展迅速,不斷出現(xiàn)新的抗蟲基因、抗旱基因、抗病基因[3],通過外源目的基因表達(dá),而進(jìn)行生物測(cè)定的篩選方法各不相同,過程復(fù)雜,篩選緩慢。特別是近年,隨著大規(guī)模轉(zhuǎn)基因研究的相繼開展,傳統(tǒng)的篩選方法已無法滿足大規(guī)模轉(zhuǎn)基因后代的高效篩選,尤其是在轉(zhuǎn)基因雜交育種中,需要在開花前得到準(zhǔn)確篩選結(jié)果,以便育種操作,傳統(tǒng)的篩選方法在效率上尚略顯不足。因此,探索一種快速,準(zhǔn)確、較為系統(tǒng)的篩選方法,進(jìn)行大規(guī)模轉(zhuǎn)基因棉花后代群體的篩選顯得尤為重要。本試驗(yàn)結(jié)合我國棉花轉(zhuǎn)基因育種中的兩個(gè)主流方法[4-5],以花粉管導(dǎo)入[6]外源基因自交系T1-T3、轉(zhuǎn)基因雜交育種F1種子為材料,探討田間卡那霉素篩選與PCR分子鑒定相結(jié)合,應(yīng)對(duì)大規(guī)模轉(zhuǎn)基因棉花后代篩選的可靠性和實(shí)用性,為轉(zhuǎn)基因棉花后代的篩選鑒定提供參考。
1材料與方法
1.1材料供試品種為綠色棉隴綠棉3號(hào)、白色棉隴棉2號(hào)、棕色棉BC05,均由甘肅省農(nóng)科院作物所棉花研究室選育、提供,具有纖維品質(zhì)優(yōu)良、產(chǎn)量穩(wěn)定等突出性狀[7-8]。轉(zhuǎn)基因鑒定的供試材料為:①通過花粉管通道法對(duì)隴綠棉3號(hào)、BC05導(dǎo)入抗蟲基因GNA、抗旱基因GhABF2的T1-T3;②WBK09、20090713-1979分別與隴綠棉3號(hào)、BC05、隴棉2號(hào)雜交F1(GNA、GhABF2的基因質(zhì)粒、引物序列由中國農(nóng)科院生物技術(shù)研究所提供;WBK09含Bt抗蟲基因,材料和引物序列均由中國農(nóng)科院生物技術(shù)研究所提供;20090713-1979含BADH抗旱基因,材料和引物序列由新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院提供),花粉管導(dǎo)入T1-T3材料為海南、敦煌兩地繁育所得,WBK09、20090713-1979與供試品種雜交F1由海南育種所得。GNA、GhABF2的基因質(zhì)粒與WBK09、20090713-1979均攜帶NPTⅡ標(biāo)記基因(新霉素磷酸轉(zhuǎn)移酶基因),該基因是目前基因工程中被廣泛使用的選擇標(biāo)記,它對(duì)植物細(xì)胞表現(xiàn)毒性的機(jī)理是:卡那霉素干擾了細(xì)胞葉綠體及線粒體的蛋白質(zhì)合成,最終導(dǎo)致植物細(xì)胞死亡,而轉(zhuǎn)基因植株抑制了這個(gè)過程[9-10]。供試材料種植于甘肅省敦煌市肅州鎮(zhèn)隔離試驗(yàn)區(qū)。分子鑒定地點(diǎn)為甘肅省農(nóng)科院生物技術(shù)研究所基因工程研究室。
1.2方法
1.2.1卡那霉素濃度梯度試驗(yàn)。設(shè)置卡那霉素3.0g•L-1、5.0g•L-1、7.0g•L-1三個(gè)處理濃度,在棉花現(xiàn)蕾期,對(duì)供試品種頂端倒數(shù)第2片真葉用毛筆涂抹藥液,各處理50株,以WBK09做對(duì)照(經(jīng)過PCR分子檢測(cè),攜帶NPTⅡ標(biāo)記基因),3~5d觀察統(tǒng)計(jì)結(jié)果。
1.2.2卡那霉素抗性植株篩選。在卡那霉素濃度梯度試驗(yàn)的基礎(chǔ)上,對(duì)轉(zhuǎn)基因供試材料進(jìn)行卡那霉素篩選,對(duì)篩選后的陽性植株做標(biāo)記,以備PCR分子檢測(cè)。
1.2.3PCR分子檢測(cè)。剪取陽性植株頂端較嫩葉片,采用改良的CTAB大量提取法[11]提取純化基因組DNA,針對(duì)陽性植株所含不同基因,利用設(shè)計(jì)好的引物(表1)進(jìn)行PCR檢測(cè)。PCR體系所用藥劑為Fermentas公司生產(chǎn),采用引物由Invitrogen公司合成,統(tǒng)計(jì)檢測(cè)結(jié)果。
2結(jié)果與分析
2.1不同品種敏感性及卡那霉素篩選條件的確定根據(jù)田間觀察結(jié)果,對(duì)棉葉與卡那霉素處理反應(yīng)的表現(xiàn)分為三個(gè)等級(jí),Ⅰ級(jí):涂抹葉片正常;Ⅱ級(jí):涂抹葉片有輕微變黃;Ⅲ級(jí):涂抹葉片具有黃色斑點(diǎn)(圖1),為了得到可靠的卡那霉素篩選結(jié)果,消除棉花葉片自身對(duì)卡那霉素具有抗性的試驗(yàn)影響,以Ⅲ級(jí)處理結(jié)果作為卡那霉素篩選標(biāo)準(zhǔn)。在該篩選標(biāo)準(zhǔn)下,對(duì)試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì),結(jié)果表明:三種濃度的卡那霉素棉葉涂抹,3~5d內(nèi),均使隴棉2號(hào)、隴綠棉3號(hào)、BC05的棉葉百分之百轉(zhuǎn)變?yōu)榫哂悬S色斑點(diǎn)的葉片;對(duì)照WBK09經(jīng)過濃度為7.0g•L-1卡那霉素棉葉涂抹,在3~5d內(nèi),葉片仍未變化。該結(jié)果表明,3.0~7.0g•L-1卡那霉素葉片涂抹,可以明顯區(qū)分轉(zhuǎn)基因與非轉(zhuǎn)基因植株。此外,參試品種在5.0g•L-1卡那霉素葉片涂抹處理下,百分之百轉(zhuǎn)變?yōu)榫哂悬S色斑點(diǎn)葉片,隴棉2號(hào)需要3d,BC05需要4d,而隴綠棉3號(hào)需要5d;因此,可以認(rèn)為,隴棉2號(hào)棉葉對(duì)卡那霉素最為敏感,BC05次之,隴綠棉3號(hào)棉葉與卡那霉素反應(yīng)最為遲緩。在保證準(zhǔn)確性的前提下,為了快速得到篩選結(jié)果,可以確定隴棉2號(hào)的最佳篩選條件為5.0g•L-1卡那霉素葉片涂抹,0~3d觀察期;BC05的最佳篩選條件為5.0g•L-1卡那霉素葉片涂抹,0~4d觀察期;隴綠棉3號(hào)的最佳篩選條件為3.0g•L-1卡那霉素葉片涂抹,0~5d觀察期(見表2)。
2.2卡那霉素篩選結(jié)果分析在確定卡那霉素篩選最佳條件后,以各品種最佳篩選條件對(duì)相關(guān)轉(zhuǎn)基因后代進(jìn)行田間篩選操作,0~5d內(nèi),共計(jì)篩選出820份葉片未變色的植株,其中,隴棉2號(hào)181株,隴綠棉3號(hào)324株,BC05315株。隴棉2號(hào)、隴綠棉3號(hào)、BC05在篩選過程中得到穩(wěn)定篩選結(jié)果的時(shí)間分別為第3d,第4d,第5d(表3),該結(jié)果表明,針對(duì)不同品種確定的最佳篩選條件具有一定的可靠性。由于操作簡(jiǎn)單,本次試驗(yàn)僅用5d完成21112份轉(zhuǎn)基因棉花后代材料的田間篩選,因此,可以認(rèn)為,田間卡那霉素篩選可以快速、準(zhǔn)確地篩選出具有卡那霉素抗性的轉(zhuǎn)基因植株。
2.3PCR分子檢測(cè)結(jié)果分析對(duì)820份陽性植株,進(jìn)一步進(jìn)行PCR分子檢測(cè),得到具備NPTⅡ標(biāo)記基因的材料806份,攜帶目的基因的材料有161份,其中轉(zhuǎn)基因雜交育種F1中,有158份含有目的基因;通過花粉管導(dǎo)入基因的T1-T3材料中,雖然有269份材料驗(yàn)證出NPTⅡ標(biāo)記基因,但只有3份材料具備目的基因(表4,圖2);經(jīng)過多次重復(fù),結(jié)果一致。該結(jié)果表明:卡那霉素陽性植株篩選的準(zhǔn)確率為98.3%,卡那霉素篩選攜帶目的基因的轉(zhuǎn)基因植株準(zhǔn)確率為20%;處于連鎖狀態(tài)的標(biāo)記基因與目的基因,在轉(zhuǎn)基因育種過程中沒有完全轉(zhuǎn)化或遺傳。
3結(jié)論與討論
本試驗(yàn)通過對(duì)隴棉2號(hào)、隴綠棉3號(hào)、BC05非轉(zhuǎn)基因植株進(jìn)行卡那霉素敏感試驗(yàn),以確定田間卡那霉素篩選的最佳條件,在此試驗(yàn)基礎(chǔ)上,對(duì)其相關(guān)轉(zhuǎn)基因后代進(jìn)行田間卡那霉素初篩,對(duì)篩選后的材料進(jìn)行分子鑒定。試驗(yàn)結(jié)果表明,在實(shí)際轉(zhuǎn)基因棉花育種中,應(yīng)對(duì)大規(guī)模轉(zhuǎn)基因棉花后代篩選鑒定,卡那霉素葉片涂抹與目的基因PCR檢測(cè)相結(jié)合,具有簡(jiǎn)單、快速、準(zhǔn)確的特點(diǎn),是一種高效的篩選方法,具備一定的實(shí)用性。在卡那霉素濃度梯度試驗(yàn)中,不同品種的棉葉對(duì)卡那霉素的敏感性不同,與白色棉隴棉2號(hào)相比,綠色棉隴綠棉3號(hào),棕色棉BC05的葉片小,蠟質(zhì)層較厚,該生理性狀影響葉片與卡那霉素反應(yīng)。王彥霞、燕麗萍、李舉等[12-14]在卡那霉素篩選研究中,使用的卡那霉素篩選濃度也各不相同。因此,不同品種在不同地區(qū)做轉(zhuǎn)基因材料田間篩選,要得到準(zhǔn)確的篩選結(jié)果,必須進(jìn)行前期梯度試驗(yàn)。在PCR分子檢測(cè)試驗(yàn)中,標(biāo)記基因鑒定結(jié)果與目的基因鑒定結(jié)果相差甚遠(yuǎn),這種情況在通過花粉管導(dǎo)入后代的材料中尤其明顯,祝建波[15]在研究過程中也發(fā)現(xiàn)類似情況,并推測(cè)原因是:在轉(zhuǎn)基因過程中,標(biāo)記基因與目的基因在核酸酶的影響下,形成不完整片段。由于這種原因一般只導(dǎo)致出現(xiàn)個(gè)別異常,在本次試驗(yàn)中,試驗(yàn)群體龐大,不會(huì)造成差異如此懸殊的標(biāo)記基因與目的基因鑒定結(jié)果,所以,在本次試驗(yàn)的基礎(chǔ)上,推測(cè)原因?yàn)椋禾幱谶B鎖狀態(tài)的標(biāo)記基因和目的基因在轉(zhuǎn)基因過程中存在分離情況。該推測(cè)需要進(jìn)一步試驗(yàn)研究進(jìn)行論證,但試驗(yàn)結(jié)果可以明確,卡那霉素篩選準(zhǔn)確率低,目的基因PCR鑒定才是準(zhǔn)確的篩選方法。在大規(guī)模轉(zhuǎn)基因棉花育種中,快速、準(zhǔn)確的篩選尤為重要。尤其在轉(zhuǎn)基因雜交育種過程中,需要在開花前得到準(zhǔn)確的篩選結(jié)果,以便進(jìn)行親本選配及雜交組合的田間操作,此時(shí),如果對(duì)轉(zhuǎn)基因育種T0進(jìn)行卡那霉素快速篩選,縮小范圍后,再進(jìn)行準(zhǔn)確的分子鑒定跟蹤,可以大規(guī)模減少后代群體,提高篩選效率,盡早篩選得到含有目的基因的轉(zhuǎn)基因材料,加快其后代進(jìn)行遺傳穩(wěn)定性、基因表達(dá)量的研究,縮短安全性申報(bào)及產(chǎn)業(yè)化進(jìn)程。