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《湖北農(nóng)業(yè)科學(xué)雜志》2014年第十一期
1結(jié)果與分析
1.1菠菜種質(zhì)資源田間性狀聚類分析對45份菠菜種質(zhì)的形態(tài)學(xué)標(biāo)記進(jìn)行聚類分析,利用SPSS11.0軟件計算出不同種群間的遺傳相似度,對數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析,構(gòu)建聚類分析樹狀圖(圖1)。如圖1所示,形態(tài)學(xué)標(biāo)記聚類將供試的45份菠菜種質(zhì)分為3個類群。第一類群:美2號、美2號×全能、美3號、“06-118”、丹麥1號、美2號ד98-58”、法國5號、美2號×聯(lián)、p07-22、“07-75”、強(qiáng)力398、荷蘭5號、“98-58”×laron、冠軍強(qiáng)力、全能×哈、美2號×羅、金成尖、法國6號×全能、福將。該類群的品種生物學(xué)特征為半直立株型,卵形葉型,葉面微皺,葉片有光澤且顏色為深綠色,葉面較厚,抽薹較晚。第二類群:マゼぅー、アニナ、07-p50、07-p24早熟、“07-74”、全能、“9508”×尖、沈尖葉、07-p24、07-p69、金成×哈、美2號ד9858”、07-p49、アスぅス×前衛(wèi)433、07-65、07-75、アスロソ、“9507”×全能、全能ד9780”、p5。此類群的主要特征是株型為半直立,葉型為橢圓形,葉面微皺,葉色為綠色,抽薹期適中。第三類群:西安大葉、虎耳菜、p40-1、“07-86”、大葉、哈×全能。此類群的主要特征是株型為半直立,葉面微皺,葉色為綠色,葉裂刻淺,葉片厚度較薄。利用形態(tài)學(xué)標(biāo)記方法對45份菠菜育種材料進(jìn)行分類,從地理分布來看,基本上可以把不同地理分布的菠菜材料分開,以歐美品種和含有歐美血統(tǒng)的雜交種的材料聚為同一類群,以日本品種和含有日本血統(tǒng)的雜交種聚為同一類群,以中國品種和含有中國血統(tǒng)的雜交種聚為一個類群。
1.2菠菜種質(zhì)田間形狀的相關(guān)性分析利用SPSS11.0軟件對45份菠菜育種材料的12個田間性狀進(jìn)行相關(guān)性分析。結(jié)果表明,有4組田間性狀呈極顯著負(fù)相關(guān),株型和葉型(相似系數(shù)-0.351)、株型和葉面褶皺(-0.518)、葉面挺直度和葉尖(-0.384)、葉尖和株型(-0.494)。其中負(fù)相關(guān)性最大的是株型和葉面褶皺(-0.518),即株型越開展,葉面的褶皺越多;有6組田間性狀呈極顯著正相關(guān),葉型和葉尖(0.636)、葉型和葉面光澤(0.469)、葉面褶皺和葉尖(0.542)、葉尖和葉厚(0.413)、葉面褶皺和葉厚(0.493)、葉色和抽薹期(0.413)。其中正相關(guān)性最大的是葉型和葉尖(0.636),說明葉尖很大程度上決定了葉片形狀,研究比較了各種質(zhì)量性狀之間的關(guān)聯(lián)性,為下一步研究其控制機(jī)理提供依據(jù)。利用SPSS11.0軟件分析了菠菜種質(zhì)田間性狀之間的關(guān)聯(lián)程度,并繪制成聚類圖。由圖2可知,菠菜的許多田間性狀關(guān)聯(lián)性很強(qiáng),鑒于這些性狀,分別針對每對相關(guān)性很高的性狀設(shè)計完整的試驗,進(jìn)一步證實其相關(guān)的可靠性,從分子水平上進(jìn)行QTL定位,驗證其性狀的位點(diǎn)與田間相關(guān)性試驗結(jié)果的一致性。
1.3AFLP分析本試驗用256對引物組合篩選出18對擴(kuò)增效果較好的引物,分別是4769、4770、4776、5176、5264、5266、5268、5269、5270、5271、5276、5476、5563、5568、5569、5572、5578、5669(圖3)。用18對引物對45份菠菜種質(zhì)進(jìn)行分析,共擴(kuò)增出960個條帶,146個多態(tài)性位點(diǎn),PIC值為15.2%。
1.4菠菜種質(zhì)AFLP分子標(biāo)記聚類分析利用NTSYS2.10e軟件對AFLP分子標(biāo)記統(tǒng)計數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析,取遺傳相似系數(shù)為0.68時,可將45份菠菜種質(zhì)分為三大類群(圖4)。第一類群:美3號、荷蘭5號、美2號、“07-75”、金成×哈、丹麥1號、全能×哈、美2號×全能、沈尖葉、美2號×羅、美2號×聯(lián)、福將、美2號ד98-58”、p07-22、“9507”×全能、美2號ד9858”、金成尖、“9508”×尖、アニナ、全能、法國5號。其中歐美材料有7個,日本材料有4份,中國材料有1份,雜交種有9份(其中有5個含有歐美血統(tǒng))。此類群主要以歐美材料和含有歐美血統(tǒng)的雜交種為主。主要特征為株型半直立,葉色深綠,抽薹期較晚,葉片有光澤且較厚。第二類群:法國6號×全能、07-p24、全能ד9780”、アスぅス×前衛(wèi)433、マゼぅー、冠軍強(qiáng)力、“07-65”、07-p24早熟、“07-74”、07-p50、“98-58”×laron、07-p49、07-p69、アスロソ、強(qiáng)力398、大葉,此類主要以日本材料和含有日本血統(tǒng)的雜交種為主,其中日本材料12份,雜交種4份(都含有日本血統(tǒng)),沒有歐美材料和中國材料。主要特征為葉片綠色,抽薹期適中,葉面微皺,葉片為橢圓形。第三類群:p5、p40-1、虎耳菜、西安大葉、哈×全能、“07-86”、“06-118”、“07-75”。中國材料6份,日本材料1份,1個雜交種(含有中國血統(tǒng)),沒有歐美材料。此類群以中國材料為主,主要特征是葉色較淺,株型的直立性較強(qiáng),抽薹比較早,葉片褶皺較少,葉片較薄。從AFLP標(biāo)記分析的結(jié)果可以看出,大多數(shù)來自同一地區(qū)或有此地區(qū)血統(tǒng)的資源聚到了一類,但還有一些例外,尤其是來自日本的品種。主要是由于育種材料中選取的日本材料比較多,所以相對于中國和歐美材料來說,多樣性豐富一點(diǎn),而且日本菠菜育種一直居于世界領(lǐng)先地位,試驗所用的一些材料很可能是日本材料和其他地區(qū)材料經(jīng)過改良后得到的產(chǎn)物,所以這些材料的自交系會分到其他類群。而一些遺傳背景很相似的材料卻被分在不的類群,可能因為它們是多代自交系,第一代的種子較雜,后代分離比較大,而且也有可能和雜交技術(shù)有關(guān)。利用Structure2.3軟件對45份菠菜種質(zhì)進(jìn)行Q值計算,結(jié)果表明(表3),除5份材料以外,其余材料的主成分都大于0.7,最大的達(dá)到0.981,說明所選育種材料的歸屬比較明確,同一類群內(nèi)親緣關(guān)系比較近,同時樣品中還存在其他類的成分,但其含量較少,說明類與類之間的親緣關(guān)系比較遠(yuǎn)。
2討論
利用AFLP分子標(biāo)記的方法,對256對P+3/M+3引物組合進(jìn)行篩選,選出18對多態(tài)性較高,且條帶清晰的引物組合。這18對引物組合共獲得960條清晰可辨的條帶,其中有146個多態(tài)性位點(diǎn),平均多態(tài)信息量為15.2%,最終把45份菠菜種質(zhì)材料分為三類。分別是歐美類群、日本類群、中國類群,根據(jù)Structure2.3軟件計算Q值,可以得出中國類群和日本類群親緣關(guān)系較近,與歐美類群親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。同時通過統(tǒng)計12個田間性狀,利用形態(tài)學(xué)分類的方法也把種質(zhì)材料分為三類,并且兩種分類方法的結(jié)果有70%左右是吻合的,45份材料中分類不一致的有14個樣品。說明傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)性狀分類和現(xiàn)代分子標(biāo)記分類在結(jié)論上比較一致,但是由于兩種分類方法基于的原理不同,其分析結(jié)果就不會完全一致。田間性狀是根據(jù)植株外形上和品質(zhì)上的差異對其分類,優(yōu)點(diǎn)是簡單、有效、實用、費(fèi)用較低。缺點(diǎn)是容易受外界環(huán)境條件和人為主觀判斷等因素的影響,此方法適用于粗略的分類。AFLP分子標(biāo)記是從DNA水平上直接根據(jù)基因的差異來分類,其優(yōu)點(diǎn)是準(zhǔn)確、不受外界環(huán)境和人為主觀判斷的影響,缺點(diǎn)是費(fèi)用較高、耗時較長、難度較大,但可以對親緣關(guān)系較近的材料進(jìn)行較為準(zhǔn)確的遺傳分析。所以兩種方法各有所長,要根據(jù)材料的具體情況決定使用的方法。本研究在DNA分子水平上證明了我國菠菜種質(zhì)具有較廣泛的遺傳背景,從而為菠菜屬種質(zhì)資源開發(fā)利用以及新品種的選育提供了參考。
作者:梅燚崔彥玲郭軍陳海麗孟淑春單位:北京市農(nóng)林科學(xué)院蔬菜研究中心農(nóng)業(yè)部華北地區(qū)園藝作物生物學(xué)與種質(zhì)創(chuàng)制重點(diǎn)實驗室農(nóng)業(yè)部都市農(nóng)業(yè)(北方)重點(diǎn)實驗室江蘇沿海地區(qū)農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所