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國家新醫(yī)改方案提出，公立醫(yī)院改革要堅(jiān)持政府主導(dǎo)與發(fā)揮市場機(jī)制相結(jié)合的要求，充分說明公立醫(yī)院改革面臨的新機(jī)遇和挑戰(zhàn)。針對目前公立醫(yī)院改革普遍存在的認(rèn)識不統(tǒng)一、政策不配套、工作不協(xié)調(diào)等主要問題，省提出了相應(yīng)的對策。

改革管辦不分，創(chuàng)新管理體制。按照醫(yī)療服務(wù)監(jiān)管職能與醫(yī)療機(jī)構(gòu)舉辦職能分開的原則，推進(jìn)政府衛(wèi)生及其他部門、國有企事業(yè)單位所屬醫(yī)院的屬地化管理，逐步實(shí)現(xiàn)公立醫(yī)院的統(tǒng)一管理。截至2009年年底，全省共完成282所國企自辦醫(yī)院的分離工作，占應(yīng)分離醫(yī)療機(jī)構(gòu)的95.3%。

改革政事不分，創(chuàng)新運(yùn)行機(jī)制。

目前，先在公立醫(yī)院全面推行院長公選制、員工聘用制與績效工資制。年8月，云南省率先在昆明地區(qū)開展執(zhí)業(yè)醫(yī)師多地區(qū)執(zhí)業(yè)試點(diǎn)，取得經(jīng)驗(yàn)后在全省推廣。截至2010年10月底，昆明市已辦理醫(yī)師多點(diǎn)執(zhí)業(yè)1098人，辦理人員占昆明地區(qū)醫(yī)師注冊人數(shù)的4.77%，其中在職人員占78.6%，退休人員占21.4%，副高以上職稱人數(shù)為740人。這次試點(diǎn)不僅促進(jìn)了優(yōu)質(zhì)醫(yī)療資源合理流動，提升了基層醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)的服務(wù)能力與水平，增強(qiáng)和規(guī)范了醫(yī)師的法律意識與職業(yè)行為，也充分體現(xiàn)了醫(yī)務(wù)人員的自身價(jià)值。

改革權(quán)責(zé)分離，創(chuàng)新監(jiān)管機(jī)制。明確界定公立醫(yī)院所有者和管理者的權(quán)責(zé)，建立醫(yī)院管理委員領(lǐng)導(dǎo)下的院長負(fù)責(zé)制，形成決策、執(zhí)行、監(jiān)督相互制衡，有責(zé)任、有激勵、有約束、有競爭、有活力的機(jī)制。

改革以藥補(bǔ)醫(yī)，創(chuàng)新補(bǔ)償機(jī)制。省首先對公立醫(yī)院提供的服務(wù)進(jìn)行了成本核算，明確了提供藥事服務(wù)的成本；其次，在成本核算的基礎(chǔ)上，調(diào)整了服務(wù)收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)；最后，落實(shí)公立醫(yī)院政府補(bǔ)助政策。我們目前考慮取消公立醫(yī)院10%的藥品加成率（年以來，省的藥品加成率一直保持為10%）。取消10%的藥品加成率之后，醫(yī)院的損失主要通過三方面來補(bǔ)償：增加藥事服務(wù)費(fèi)，提高服務(wù)收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)，政府投入。其中，增加藥事服務(wù)費(fèi)的費(fèi)用占三成，政府投入占四成，從而解決醫(yī)院取消藥品加成率以后藥品獲利虧空的問題。

改革公強(qiáng)民弱，創(chuàng)新競爭機(jī)制。鼓勵、支持和引導(dǎo)社會資本發(fā)展醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)，先后通過股份合作辦醫(yī)、股份制合資辦院、聯(lián)合國有企業(yè)辦院、全資收購公立醫(yī)院、組建大型醫(yī)療集團(tuán)、省市單位聯(lián)合辦院、吸引品牌醫(yī)院辦院，以及大力發(fā)展民辦醫(yī)院等方式，加快形成投資主體多元化、投資方式多樣化的辦醫(yī)體制。