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1思想觀念存在誤區。
一是把非公有制經濟看作是社會主義公有制經濟的異已力量，對非公有制經濟的比重非常敏感，生怕其做大；二是仍把非公有制經濟當做所謂“補充”，認為只能拾遺補缺，派不了大用場；三是認為發展非公有制經濟是我國當前國有經濟效率低下、國有企業困難重重，為解燃眉之急、應一時之需的權宜之計。而沒有看到非公有制經濟在解決就業崗位、增加財政收入、創新管理制度、活躍市場競爭、培養營銷人才等方面發揮的不可替代的作用。
2立法保護尚有缺陷
從憲法來看，圍繞私有財產權和非公有制經濟，20世紀80年代以來的歷次修憲，均進步顯著，從82年的“國家保護公民的合法收入、儲蓄、房屋和其它財產的所有權。國家依照法律規定，保護公民私有財產的繼承權”到88年增加規定“國家保護私營經濟的合法權利和利益”，再到99年規定“國家保護個體經濟、私營經濟的合法權利和利益”，都承認和保護私有財產，但從立法用語上分析，仍不能說憲法對私人財產的保護與對國有財產的保護完全處在同一水平。其次，現行憲法對私人財產在何種情況下才可限制和剝奪，即如何對私人財產實行國有化、征收及征用，如何補償，也未作規定，這是憲法保障的一大缺的。再則，憲法只有“在法律范圍內的個體經濟、私營經濟等非公有制經濟，是社會主義市場經濟的重要組成部分”來表述非公制有經濟在國民經濟中的地位及其發展保護，而未從保護私人財產的角度加以規定。另外，憲法只強調對公民的合法的收入、儲蓄、房屋和其他合法財產即生活資料所有權的保護，而忽視了公民合法的生產資料的所有權保護，顯然是立法上的滯后。
作為調整平等主體之間人身財產關系的民法在保護私人財產的同時，更強調社會主義公有財產的絕對主導地位，對保護私有財產的規定反而不太確鑿《民法通則》第五章第一節，這與民法的平等精神相沖突，使得民法作為私法、權利法的價值目標無法突出。
1988年頒布的《私營企業暫行條例》等一批專門規定非公有制經濟的法律法規對非公有制經濟的權利和義務規定得較為籠統，缺乏具體剛性的規定，保護比較薄弱，當其權益受損害時，難以得到及時有效的法律保護。
法律上對私有財產保護的模糊及對非公有制經濟的限制，使得億萬勞動者創造財富、愛護財富和積累財富的熱情受到壓制，尤其是促使許多私營企業主把資產轉向境外，導致資本外流，不僅阻礙了私有經濟的進一步發展，而且對國民經濟造成負面影響，不利于我國基本經濟制度的堅持和完善。
3行政管理乏善可陳。
對非公有制經濟的發展，法律明文限制的雖然不多，但由于主動保護不到位，導致弊政叢生，行政水平低下，管理體制不順，政府侵害非公有制經濟合法權益的情況時有發生。表現為政出多門、配合不力、職能交叉、辦事效率低、服務意識差等，相對立法而言，部門、地方規章、政策及具體行政行為阻礙非公有制經濟發展的因素更多。全國人大常委會剛剛出臺的《行政許可法》對非公有制經濟不啻為一個福音，如能切實貫徹執行，將極大地推動非公有制經濟法律政策環境地改善，意義非同一般。
4市場環境差強人意。我國尚處在市場經濟的初創階段，市場對資源配置的基礎性作用還沒有完全實現，非公有制經濟還缺乏平等競爭的市場環境，如在市場準入方面，現行法規和政策限制個、私經濟進入基礎產業、公用事業和金融、保險、證券、石油、汽車等重要行業；私營企業沒有進出口經營權，也不能在境外設立分支機構，無法直接進入國際市場；在國有企業改革過程中，對個體、私營經濟兼并、收購、承包、租賃國有中小企業也存在種種限制；在稅收政策和土地等生產要素的分配方面，也存在不平等待遇。此外，缺乏金融機構的信貸支持是制約非公有制經濟發展壯大的又一瓶頸。迫使其通過非正規渠道獲取資金，增加了融資成本和經營風險。
5司法保護未能充分發揮應有的作用。
人民法院適用法律居中獨立裁判，本可排除適用政府作出的有悖法律精神和原則的規范性文件，并排除一切不當干擾，成為非公有制經濟最可靠的保障，但由于體制上的原因，司法機關有時在一定程度上難以實現獨立性。政府通過司法對公有制經濟提供特殊的法外保護提供了便利條件，相對于非公有制經濟而言就是一種不平等待遇，當兩者利益相沖突時勢必損害其利益。
完善非公有制經濟法律保護的意義。
非公有制經濟的發展對提高生產力，堅持社會主義經濟制度，全面建設小康社會有重要意義。沒有非公有制經濟就沒有市場經濟，公有制經濟和非公有制經濟不僅相互競爭，更重要的是兩者之間的協作和互補。其次，有利于良好社會環境和市場秩序的形成，那些市場和行政管理中常見的，隨意侵犯投資經營權、久拖債款不還、巧立名目亂攤派等擾亂正常社會經濟秩序的事件得以有效遏制，促使法治觀念和誠信意識的養成；再次，有利于吸引更多的資本參與國民經濟建設，最后，有利于實現共同富裕。
進一步完善非公有制法律保護的建議。
1立法建議。
十六大報告指出：判斷人們政治上先進和落后的標準并非在于有沒有財產、有多少財產，而主要看他們的思想政治狀況和現實表現，看他們的財產是怎么得來的以及對財產如何支配和使用的，看他們是否以自己的勞動對中國特色社會主義事業作出貢獻；提出“依法加強監督和管理，促進非公有制經濟健康發展；完善保護私人財產的法律制度”，這應當成為在新的歷史條件下加強非公有制經濟和私人財產保護立法的政策依據。事實上，近年來財產權問題一直是中國法律修改的中心議題，十六大后國家必將進一步加強對非公有制經濟和私人財產的保護，提高法律保護的層次。
產權制度是市場經濟的基礎制度，目前，我國在法律上對私人財產權缺乏明確的定義，非公有制經濟的發展還存在許多產權保護方面的法律障礙。近年來，來自各個層面的有關完善保護非公有制經濟和私人財產制度的呼聲越來越高。但是，在是通過修憲還是通過另行立法來保護私人財產的問題上，學界產生了分歧。有的學者認為，保持目前憲法不變，而另制定一套財產法或私有財產法，保護私有財產和私有生產資料的所有權。我們認為，重新立法不能代替修改憲法，憲法不修改，重新立法就沒有憲法基礎，其效力會受到質疑。同時，私人財產權是自由競爭和市場經濟的基石，它比公共財產權具有更強的利益動機和更低的監督成本，更能使社會資源配置優化，使財富的社會效應最大化，私有財產保護是人權保護的基礎制度，屬憲法規制的范疇。故應當首先通過修憲明確規定私人財產的法律地位及其保護，建議將私人財產與國有財產提高到同一層次加以界定和保護，明確規定“私人財產權是指包括自然人以及個體經濟、私營經濟和其他非公有制經濟主體，對其不動產和動產享有全面支配的權利?！?，同時明確：“對私人財產權的限制和剝奪，必須有法律規定，并給予充分、及時、有效的補償?！比缓笾贫ㄘ敭a法或者在擬制定的民法典中對私人財產權作專章規定，對限制和剝奪私人財產權的法定條件、程序及相應的補償加以詳細規定。民法作為私法，國家一般不應成為其法律關系的主體，對國有、集體經濟的財產權也不應給予特殊保護。另外，《私營企業暫行條例》法律位階太低，保護力度不足，應由全國人大常委會制定這方面的法律，并細化非公有制經濟體的權利及相應的保護措施。
2司法中需要解決的問題。
司法的中立性、公開性要求司法機關在審判工作中應當平等保護各方當事人的利益，切實保障當事人法定訴訟權利的實現，非公有制經濟主體的權利當然不能排除在外。非公有制經濟所處的社會位置決定它本能的呼喚法治，反對特權，呼喚法院獨立審判，反對行政干預，所以它是我國社會法治化一支重要的促進力量。返過來，司法的固有屬性決定了司法應成為保護非公有制經濟的最后屏障和重要的救濟途徑。實踐中對保護非公有制經濟存在的不足是現行體制中阻礙司法獨立與公正實現的不合理制度造成的，并不僅僅是非公有制經濟單獨面臨的問題，需要通過司法體制加以解決。司法機關對司法體制改革雖然熱情很高，投入了大量的資源，但由于有些問題是司法機關自身難以克服的，所以效果并不十分理想。要徹底解決這些體制上的弊端，需要有一個更高的權威，站在更高的層次上統籌規劃，統一指揮司法改革。令人欣慰的是司法體制問題已引起了黨中央的高度關注，在十六大報告中對此進行了專門論述，要求“完善司法機關的機構設置、職權劃分和管理制度”，“從制度上保證審判機關和檢察機關依法獨立公正地行使審判權和檢察權”，“改革司法機關的工作機制和人財的管理機制”。當前司法機關要做的就是積極推動這些改革目標的實現，同時扎扎實實地從微觀上改善非公有制經濟面臨的司法環境，針對非公有制經濟相對于公有制經濟所處的弱勢地位，采取一些特殊的保護措施以平衡二者的利益關系，實現司法保護的獨特價值。相信隨著法治進程的不斷深入，非公有制經濟面臨的司法環境乃至整個法制環境都會得到逐步改善，直至實現完全平等保護。