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《生物技術雜志》2014年第二期
1材料和方法
1.1材料
1.1.1實驗材料釀酒酵母Y187(Matα,trp1-901,leu2-3,112,ura3-52,his3-200),DH5α(supE44,Δlac,U169,hsdR17,recA1,en-dA1,gyrA96,thi21,relA1),pPIC9K和pADH1均為作者實驗室保存。
1.1.2試劑SacⅠ、ClaⅠ、XbaⅠ等限制酶,T4DNA連接酶和PCR產物純化試劑盒由北京全式金生物技術有限公司提供。
1.1.3培養基LB培養基:1%胰蛋白胨,0.5%酵母提取物,0.5%氯化鈉,pH7.0。YPDA培養基:1%酵母提取物,2%多價蛋白胨,2%葡萄糖,0.003%腺嘌呤,pH6.5。YPD培養基:1%酵母提取物,2%多價蛋白胨,2%葡萄糖,pH6.5。1.2方法
1.2.1相關基因的克隆和序列分析以質粒pPIC9K為模板,以F(s):5’-CGGGAGCTCAT-GAGATTTCCTTCAATTTTTACT-3’和R(s):5’-GGCATCGATCGGATCCAGCTTCAGCCTCTCTTTTCT-3’為引物擴增信號肽編碼序列。以釀酒酵母基因組為模板,以F(agg):5’-GGGGAATTCTCTAGAGGTGGTGGTGGTTCTCAT-CATCATCATCATCATAGCGCCAAAAGCTCTTTTAT-3’和R(agg):5’-GGGGCATATGTTTGATTATGTTCTTTCTATTTGAAT-3’為引物擴增錨定序列。上游引物F(agg)中下劃線堿基序列依次是編碼EcoRⅠ和XbaⅠ識別序列,黑體部分是引入的Gly4Ser連接肽和6×HisTag,連接肽的引入以減少蛋白折疊的空間位阻效應,His標簽的引入為展示蛋白(用抗His標簽抗體檢測)的檢測和純化(親和層析柱)提供了方便;下游引物中下劃線部分編碼NcoⅠ的識別序列。以pEGFP-C1為模板,以F(gfp):5’-TCCCCCGGGATGGTGAGCAAGGGCGAG-GAGC-3’和以R(egfp):5’-GCTCTAGACTTGTA-CAGCTCGTCCATGCCGA-3’為引物擴增EGFP編碼序列,引物中下劃線分別編碼XbaⅠ和SmaⅠ位點。信號肽,凝集素和綠色熒光蛋白的編碼序列的PCR擴增條件為:94℃預變性4min,94℃變性30s,58℃退火40s,72℃延伸1~3min,72℃延伸7min,共30個循環。序列分析由上海生物工程公司完成。
1.2.2表面展示載體的構建及其驗證用SacⅠ和ClaⅠ雙酶切信號肽編碼序列和載體pADH1,通過T4連接酶將信號肽編碼序列插入載體pADH1以構建酵母分泌型表達載體pADH1-signal。用F(s)和R(s)引物對重組載體進行PCR驗證,用SacⅠ和ClaⅠ對重組載體進行雙酶切驗證。用EcoRⅠ和SmaⅠ雙酶切載體pADH1-signal和錨定序列,通過T4連接酶將錨定序列插入到分泌型載體pADH1-signal中,構建展示表達載體pADH1-agg。用F(agg)和R(agg)引物對展示表達載體進行PCR驗證,用EcoRⅠ和SmaⅠ對展示表達載體進行雙酶切驗證。相關的酶切,連接和轉化等分子生物學操作采用分子克隆手冊方法,具體參見“Sam-brook&Russell,2001”。
1.2.3酵母表面展示載體的功能驗證———EGFP展示用XbaⅠ和SmaⅠ雙酶切EGFP和載體pADH1-agg,通過T4連接酶將EGFP編碼序列插入到載體pADH1-agg中,構建展示表達載體pADH1-EGFP。以F(egfp)和R(egfp)為引物進行PCR鑒定,用HindⅢ對pADH1-EGFP和pADH1進行酶切鑒定。分別將含有pADH1-EGFP和pADH1-AGG的酵母在YPDA培養基培養72h(30℃、200r/min)。5000r/min離心5min收集菌體,并用無菌水洗滌菌體2次;用無菌水稀釋菌體并分別熒光顯微鏡的可見和藍光下觀察菌體(10×100倍)。
2結果與分析
2.1相關基因的克隆及序列分析用方法
2.2.1擴增相關的序列,所得到的PCR產物分別經瓊脂糖凝膠電泳分析,結果見圖2。由圖2中可以看出,得到了267bp的信號肽序列、1623bp的凝集素編碼序列和717bp的綠色熒光蛋白編碼序列。DNA序列的測序結果顯示:信號肽編碼序列和GenBank上gi309774076的序列一致,錨定序列與GenBank上gi171041序列一致。EGFP的編碼序列與GenBank上JQ064509.1的序列一致。
2.2表面展示載體的構建
2.2.1酵母分泌型表達載體的構建及驗證用方法
2.2.2構建酵母分泌表達載體并驗證,其結果見圖3。用引物F(s)和R(s)從重組載體中擴增出與預期大小一致的267bp的片段。用SacⅠ和ClaⅠ雙酶切載體pADH1-signal和pADH1的結果顯示:酶切pADH1-signal得到約267bp和7200bp的片段,其中,267bp的片段與信號肽編碼序列大小一致,表明信號肽基因已成功插入到pADH1載體中,pADH1-signal構建成功。
2.2.2酵母展示載體的構建和驗證用方法
1.2.2構建酵母表面展示載體并驗證,結果見圖4。用引物F(agg)和R(agg)從重組載體中擴增出與預期大小一致的1623bp的片段,用EcoRⅠ和SmaⅠ酶切pADH1-agg得到約1645bp和7200bp的酶切片段,其中1645bp的片段大小與錨定序列大小一致,而酶切pADH1-signal后沒有得到1645bp大小的片段,表明錨定序列已成功插入到pADH1-signal載體中,pADH1-agg構建成功。
2.2.3酵母表面展示載體的功能驗證———EGFP展示通過方法
2.2.3將EGFP編碼序列插入pADH1-agg并對重組載體進行PCR和雙酶切驗證。結果見圖5。用引物F(egfp)和R(egfp)從重組載體中擴增出與預期大小一致的717bp的片段。用HindⅢ酶切載體pADH1-egfp可得到大小約2650bp和7200bp的酶切片段,其中2650bp的片段包括267bp的信號肽,1623bp的錨定序列和717bp的EGFP序列,序列總長度與預期一致。而HindⅢ酶切pADH1-agg后不能得到2650bp的片段,表明EGFP序列已插入pADH1-agg中,pADH1-EGFP構建成功。通過方法
2.2.3用熒光顯微鏡觀察菌體細胞,其結果如圖6所示,從圖6可以看出:含pADH1-GFP的酵母菌在可見光下無熒光,但在藍光下有綠色熒光,而陰性對照菌株pADH1-AGG在可見光和藍光下均無熒光。這表明EGFP在酵母中成功地得到了表達。
作者:張秀艷侯曉彥陳福生王小紅單位:華中農業大學食品科技學院